黃宣誠

Hsuan-Cheng Huang・醫學院・生物醫學資訊研究所

碩士平均畢業時長

2.32 年

中位數 2.00 年・29 人

博士平均畢業時長

7.01 年

中位數 6.88 年・6 人

收錄論文

36 篇

100–114 學年度

全校中位數（供對照）

碩士 2.10・博士 6.11 年

畢業時長趨勢

每學年度畢業人數

只計入有論文收錄的畢業生；中途休學或更換指導教授的學生不會出現在這裡。

研究關鍵字

機器學習Machine Learning單細胞定序microRNA單細胞深度學習RNA velocityDeep learningsingle-cell RNA sequencing長鏈非編碼核醣核酸lncRNA長鏈非編碼核糖核酸蛋白質交互作用網路protein interaction network微型核糖核酸RNA速度Single cell細胞分化Cell differentiation單細胞RNA定序scRNA-seq腫瘤微環境Tumor Microenvironment細胞離散度Cell dispersion長鏈非編碼核醣核酸調控網路ceRNA超級增強子蛋白質交互作用轉錄因子Protein-Protein Interaction競爭內生性核糖核酸乳癌breast cancer老藥新用藥物與疾病關聯異質網路嵌入可解釋深度學習網路阿茲海默症Drug repurposingDrug-disease associationsHeterogeneous embeddingInterpretable deep learning networkAlzheimer's disease空間轉錄組學數據整合Spatial transcriptomicsData integration單細胞資料分析RNA 速度

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指導論文

學年度	論文	學制	入學	提交日期	畢業時長
114	HEDDI-Net：應用於藥物疾病關聯預測與老藥新用之異質網路嵌入模型 HEDDI-Net: A Heterogeneous Network Embedding Framework for Drug-Disease Association Prediction and Drug Repurposing 生物醫學資訊研究所老藥新用、藥物與疾病關聯、異質網路嵌入、可解釋深度學習網路、阿茲海默症、Drug repurposing、Drug-disease associations、Heterogeneous embedding、Interpretable deep learning network、Alzheimer's disease	博士	109	2026-06-12	5.86 年
114	SpatioVelo:整合單細胞 RNA 定序與空間轉錄體學推論空間RNA速度 SpatioVelo: Spatial RNA velocity inference by integrating scRNA-seq and spatial transcriptomics 生物醫學資訊研究所空間轉錄組學、RNA速度、單細胞、深度學習、數據整合、Spatial transcriptomics、RNA velocity、Single cell、Deep learning、Data integration	碩士	113	2026-06-10	1.86 年
113	模擬單細胞動態擾動以預測發育軌跡 Modeling Cell-Specific Kinetic Perturbations for Determining Developmental Trajectories 生物醫學資訊研究所單細胞資料分析、RNA 速度、轉錄體動態、神經網路模型、細胞分化、歐拉法、基因調控變異性、Single-cell data analysis、RNA velocity、Transcriptome Dynamics、Neural network model、Cell differentiation、Euler method、Gene regulation variability	碩士	112	2025-06-25	1.90 年
113	運用病患組織單細胞RNA定序數據預測有效的抗癌藥物組合 Predicting Effective Anti-Cancer Drug Combinations Using Patient-Derived Single-Cell RNA-Sequencing Data 生物醫學資訊研究所藥物組合、藥物作用機制、抗癌藥物、機器學習、單細胞RNA定序、Drug Combination、Mechanism of Action、Anti-Cancer Drug、Machine Learning、scRNA-seq	碩士	112	—	無法計算
112	探索賀爾蒙陽性乳癌與年齡相關的基因表現：癌症基因體資料庫之分析 Insights into Age-Related Differences in Hormone Receptor-Positive Breast Cancer: An Analysis of Public Genomic Databases 生物醫學資訊研究所賀爾蒙陽性乳癌、年齡、免疫、腫瘤微環境、TNFSF11、Hormone Receptor-Positive Breast Cancer、Age、Immunity、Tumor Microenvironment	碩士	111	2024-08-05	2.01 年
112	利用細胞基因表現離散度預測年齡 Predicting Age with Cellular Gene Expression Dispersion 生物醫學資訊研究所單細胞轉錄組定序、周邊血單個核細胞、細胞離散度、機器學習、老化生物標記、single-cell RNA sequencing、Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC)、Cell dispersion、Machine learning、Aging biomarker	碩士	111	2024-07-31	2.00 年
112	JuloVelo:整合細胞個別動態的單細胞RNA速度深度學習模型 JuloVelo: A deep learning framework for modeling single-cell RNA velocity with cell-specific kinetics 生物醫學資訊研究所單細胞、RNA速度、深度學習、細胞分化、細胞動力學、Single cell、RNA velocity、Deep learning、Cell differentiation、Cell kinetics	碩士	111	2024-07-23	1.98 年
111	使用單細胞染色質開放程度和基因表達數據推斷細胞分化的方向 Inference of cellular differentiation directions using single-cell chromatin openness and gene expression data 生物醫學資訊研究所單細胞定序、多體學、細胞分化方向、亂度、Single-cell sequence、Multi-omics、Cell differentiation direction、Entropy	碩士	110	2023-07-04	1.92 年
110	預測單細胞基因共表現網路模組 Predicting single-cell gene co-expression network modules 生物醫學資訊研究所單細胞定序、基因共表達、細胞功能、機器學習、基因網路、網路模組、Single-cell RNA-seq、gene co-expression、cell function、machine learning、gene network、network module	碩士	108	2022-08-30	3.08 年
110	透過整合單細胞定序資料探討不同腫瘤類型中T細胞的異質性 To investigate the heterogeneity of T cell subpopulations across tumor types by integrating single-cell RNA-seq data 生物醫學資訊研究所・共同指導：許家郎單細胞定序、T細胞、疲乏T細胞、腫瘤微環境、免疫檢查點抑制劑、single-cell RNA sequencing、T cell、exhausted T cell、tumor microenvironment、immune checkpoint inhibitor	碩士	109	2022-08-29	2.08 年
110	探索與預後相關的肺腺癌腫瘤內微生物體表徵 Prognosis-associated intratumor microbiome signatures in lung adenocarcinoma 生物醫學資訊研究所微生物組、腫瘤內微生物組、腫瘤轉錄組、肺腺癌、癌症預後、Microbiome、Intratumor microbiome、Tumor transcriptome、LUAD、Cancer Prognosis	碩士	109	2022-08-15	2.04 年
110	利用COVID-19單細胞轉錄體基因表現離散度預測感染嚴重程度 Gene expression dispersion infers COVID-19 severity from single-cell transcriptomic data 生物醫學資訊研究所單細胞轉錄體、新型冠狀病毒、基因表現離散度、離散指數、細胞離散度、single-cell transcriptome、COVID-19、gene expression dispersion、dispersion index、cell dispersion	碩士	109	2022-08-08	2.02 年
109	整合單細胞RNA定序資料以模擬去除雜訊的傳統RNA定序資料 Ensemble of scRNA-seq data to simulate denoised bulk RNA-seq data 生物醫學資訊研究所單細胞定序、轉錄組定序、K-近鄰演算法、scRNA-seq、RNA-seq、k-nearest neighbors	碩士	108	2021-07-29	1.99 年
109	以多階段三維卷積類神經網路辨識動物行為 Animal Behavior Recognition Based on A Multi-stage Approach of 3D Convolutional Neural Networks 生物醫學資訊研究所・共同指導：施純傑深度學習、卷積神經網路、行為類別、動作辨識、deep learning、convolutional neural network、behavior classification、action recognition	碩士	106	2021-01-31	3.50 年
108	在單細胞層次辨識有作用之基因共表現網路模組 Identification of active gene co expression network modules at the single cell level 生物醫學資訊研究所單細胞、單細胞RNA定序、機器學習、基因共表達網路、single-cell、single-cell RNA sequencing、machine learning、gene co-expression network	碩士	107	2020-07-21	1.97 年
106	調控反饋迴路橋接人類基因調控網路及癌變 Regulatory feedback loops bridge the human gene regulatory network and regulate carcinogenesis 生物醫學資訊研究所・共同指導：林振慶基因調控網路、癌變、反饋迴路、gene regulatory network、regulatory bridge、carcinogenesis、feedback loop	逕讀博士	97	2018-08-23	10.06 年
106	個人基因變異與疾病關聯視覺化系統 Web-based visualization system for individual gene variants and their associated diseases 生物醫學資訊研究所精準醫學、次世代定序、巨量生醫序列資料、關聯性分析、Precision medicine、Next-Generation Sequencing、Big biomedical sequence data、Association analysis	碩士	105	2018-08-21	2.05 年
106	鑑定毛果楊木質素合成基因在乾旱脅迫下的直接調控者 Identification of direct regulators of monolignol biosysthesis genes during drought stress in Populus trichocarpa 生物醫學資訊研究所・共同指導：林盈仲差異表達基因、None	碩士	103	2018-08-17	4.04 年
106	長鏈非編碼核糖核酸調控網路整合分析研究平台 Lncternet: a web-based application for integrative analysis of lncRNA modulation networks 生物醫學資訊研究所長鏈非編碼核醣核酸、競爭性內生性核糖核酸、長鏈非編碼核醣核酸調控網路、lncRNA、ceRNA、lncRNA association network	碩士	105	2018-07-18	1.96 年
106	探勘神經母細胞瘤長非編碼核糖核酸MYCN調控機制 Mining MYCN Regulated Long Noncoding RNAs in Neuroblastoma 生物資訊及系統生物研究所・共同指導：何信瑩神經母細胞瘤、長非編碼核糖核酸、SNHG1、共表現研究、無事件存活、預後基因標記、Neuroblastoma、long noncoding RNAs、Co-expression study、event-free survival、prognostic gene signature	博士	102	2018-06-06	4.85 年
106	分析比較基因體學及研究微生物群落來探索乳酸菌潛在有益功效 Exploration of beneficial functionality of lactic acid bacteria by analysis of comparative genomics and microbial community 生物醫學資訊研究所・共同指導：渡邊幸一乳酸菌、比較基因體學、細菌素、菌叢生態、微生物菌相、人類母乳、lactic acid bacteria、comparative genomics、bacteriocin、microbial community、microbiota、breast milk	博士	99	2017-10-26	7.24 年
105	木質素合成基因拷貝數量與S/G比率之間的相互關係 The correlation between the copy number of lignin biosynthesis genes and lignin S/G ratio 生物醫學資訊研究所・共同指導：林盈仲基因拷貝數量、S/G比率、木質素、gene copy number、S/G ratio、lignin	碩士	102	2017-08-14	4.04 年
105	建立利用PCR的定序資料分析人類MHC區域之MICA基因單套體分型系統 A Pipeline to analyze MICA haplotype typing by polymerase chain reaction sequences 生物醫學資訊研究所・共同指導：李御賢單套體分型、MICA基因、haplotype typing、MICA gene	碩士	101	2017-08-10	5.02 年
105	乳癌中超級增強子核醣核酸與基因共表現網路之關係 Super-enhancer RNA associated gene co-expression networks in breast cancer cell 生物醫學資訊研究所超級增強子、MCF-7、共表現網路、super-enhancers、MCF7、co-expression networks	碩士	104	2017-07-24	1.98 年
105	利用蛋白質交互作用網路探索肺癌中長鏈非編碼核醣核酸之功能 Exploring lncRNA functions in lung cancer based on associated protein-protein interaction network 醫學生物技術暨檢驗學系・共同指導：林文昌長鏈非編碼核醣核酸、蛋白質交互作用、肺癌、轉錄因子、long non-coding RNA (lncRNA)、protein-protein interaction (PPI)、lung cancer、transcription factor (TF)	博士	99	2017-02-10	6.53 年
104	生物網路模組功能分類視覺化研究 HANAKO: Visualization of functional classification for targeted network module 生物醫學資訊研究所 Cytoscape、交互作用網路、ClueGO、interaction network	碩士	103	2016-07-14	1.95 年
104	利用超級增強子核醣核酸辨識細胞狀態 Identification of cell states using super-enhancer RNA 生物醫學資訊研究所超級增強子、超級增強子核醣核酸、細胞狀態、super-enhancer RNA、super-enhancer、enhancer RNA、FANTOM、cell state	碩士	103	2016-06-27	1.91 年
103	分析LINCS細胞表現巨量數據萃取人類基因關連網路 Extracting Human Genetic Associations from Library of Integrated Network-based Cellular Signatures 生物醫學資訊研究所基因交互作用、蛋白質-蛋白質交互作用、LINCS、Genetic Associations、Protein-Protein Interaction	碩士	102	2015-08-25	2.06 年
103	依內源性核酸競爭理論分層解析長鏈非編碼核糖核酸調控網路 Stratification of lncRNA modulation networks with ceRNA hypothesis 生物醫學資訊研究所長鏈非編碼核糖核酸、競爭內生性核糖核酸、核糖核酸共調控網路、lncRNAs、ceRNAs、co-regulatory networks	碩士	102	2015-08-05	2.01 年
103	長鏈非編碼核醣核酸之蛋白質交互作用網路關聯模組 Lncin: long non-coding RNA-associated modules in protein interaction networks 生物醫學資訊研究所長鏈非編碼核醣核酸、蛋白質交互作用網路、長鏈非編碼核醣核酸調控網路、lncRNA、protein interaction network、lncRNA-regulated network	碩士	102	2015-08-03	2.00 年
102	長鏈非編碼核糖核酸調控之網路特性分析 Characterization and Stratification of LncRNA Modulation Networks 生物醫學資訊研究所長鏈非編碼核糖核酸、競爭內生性核糖核酸、微型核糖核酸、核糖核酸調節網路、lncRNA、ceRNA、microRNA、modulation network	碩士	101	2014-08-16	2.04 年
102	長鏈非編碼核糖核酸關聯之蛋白質交互網路及其功能分析 Identification of LncRNA-Associated Protein-Protein Interaction Networks and Their Functions 生物醫學資訊研究所長鏈非編碼核糖核酸、信使核糖核酸、皮爾森相關係數、蛋白質交互作用、長鏈非編碼核糖核酸調控網路、Long non-coding RNA、Message RNA、Pearson's correlation coefficient、Protein-protein interaction、LncRNA-associated network	碩士	101	2014-08-01	2.00 年
102	乳癌微型核醣核酸與轉錄因子共調控模組之關聯研究 Identification of MicroRNA and Transcription-Factor Co-Regulatory Modules in Breast Cancer 生物醫學資訊研究所微型核糖核酸、轉錄因子、蛋白質交互作用網路、乳癌、microRNA、transcription factor、protein interaction network、breast cancer	碩士	101	2014-07-24	1.98 年
101	預測蛋白質交互作用網路微型核醣核酸調控模組 Mirin: Identifying MicroRNA Regulatory Modules in Protein-Protein Interaction Network 生物醫學資訊研究所微型核醣核酸、蛋白質交互作用網路、微型核醣核酸調控網路、microRNA、protein interaction network、microRNA-regulated network	碩士	100	2013-08-16	2.04 年
101	子宮頸癌與卵巢癌的表基因體學分析 Epigenomic analysis of cervical and ovarian cancers 生物醫學資訊研究所・共同指導：賴鴻政表基因體學、子宮頸癌、卵巢癌、甲基化去氧核苷酸、Epigenomics、cervical cancer、ovarian cancer、DNA methylation	博士	94	2013-02-06	7.52 年
100	乳癌中選擇性多腺苷酸化模式與微型核糖核酸調控之關聯研究 MicroRNA Modulation of Alternative Polyadenylation Pattern in Breast Cancer Cells 生物醫學資訊研究所選擇性多腺苷酸化、微型核糖核酸、乳癌、Alternative Polyadenylation、MicroRNA、Breast Cancer	碩士	99	2012-07-06	1.93 年